Das ZfKD wurde im Januar 2010 auf der Basis des Bundeskrebsregisterdatengesetzes (BKRG) in der Abteilung „Epidemiologie und Gesundheitsmonitoring“ im Robert Koch-Institut eingerichtet. Es setzt die Arbeit der „Dachdokumentation Krebs“ mit erweitertem Aufgabenspektrum fort.